La creación del Museo Pino Pascali se remonta a 1998, después de una dotación importante de la familia del artista de sus obras y objetos de interés. En 2010, con la participación de la región de Puglia y el municipio de Polignano a Mare, el museo se convirtió en la Fundación Pino Pascali. La sede actual es un antiguo matadero municipal restaurado con vistas al mar.
Las actividades de la Fundación se basan en la figura de Pino Pascali, uno de los exponentes más importantes del arte contemporáneo italiano e internacional en la década de 1960, que murió a la temprana edad de 33 años en Roma. Pascali ha sido un punto de referencia fundamental para el desarrollo de las actividades de exhibición del museo. La Fundación tiene como objetivo ofrecer la visión más ecléctica del arte posible, en línea con las principales investigaciones lingüísticas de vanguardia del momento. Además de una gran cantidad de obras de Pino Pascali, el museo exhibe piezas de los pintores más importantes de Pugliese y las obras de los artistas ganadores del Premio Pino Pascali.
La colección permanente y las exposiciones temporales le dan al público una oferta cultural que cumple con los estándares de museos más respetados en el mundo, hasta el punto de que se le otorgó el primer lugar como la Mejor Fundación de Arte Contemporáneo en Italia en 2013.